2021年1月14日，中国科学技术大学附属第一医院（原徽省立医院）、中国科学技术大学、瀚因生命，联合在Journal of Autoimmunity上发表题为《Profiling of the immune repertoire in COVID-19 patients with mild, severe, convalescent, or retesting-positive status》的文章。该研究对新冠患者（轻度、重度、恢复期、再检测阳性）外周血单核细胞（PBMCs）进行转录组和免疫受体库（IRR）测序，提出了一种基于COVID-19严重程度机制中的炎症和高凝途径的双重损伤机制，并开发出可用于筛选COVID-19严重程度的潜在预测因素的机器学习模型（A machine-learning model，MLM）。同时分析了不同程度患者抗体状态。这些结果为COVID-19结果提供了潜在的预测因素，并为COVID-19治疗提供了新的潜在治疗靶点。

（文章链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0896841121000044?via%3Dihub，影响因子：14.511）

图1：瀚因生命携手中科大发表Journal of Autoimmunit文章

在过去的20年里，由冠状病毒家族成员引起的传染病在人群中肆虐了三次：严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV)、中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）和SARS-CoV-2。新冠病毒传染性强，病程长，包括症状明显的急性感染期和可能反复出现的慢性恢复期。同时，中国武汉的一项临床随访研究显示，“再检测阳性”（RTP）患者的患病率为~3%，这些患者无明显临床症状或疾病进展，可能增加了COVID-19再传播的风险。因此，寻找重症患者或“再检测阳性”（RTP）患者的标记物是观察COVID-19预后并制定有针对性的治疗和早期预防措施的重要机会。

在此背景下，瀚因生命创始人兼首席科学家、中科大生医部瞿昆教授团队对来自4组COVID-19患者（轻、重、恢复期、RTP）和健康对照组的47个外周血单核细胞样本，通过转录组测序和IRR测序分析急性感染或恢复期COVID-19患者，揭示了COVID-19严重程度的加速和恶化机制，确定与感染时和恢复期患者的COVID-19结局相关的潜在预测因子，明确了RTP患者的B细胞受体（BCR）与T细胞受体（TCR）特征，为COVID-19的精准治疗提供了潜在的指导。

图2：COVID-19严重程度和复检阳性状态中与免疫反应相关的特征标记

研究经转录组分析发现，T细胞数量的减少是COVID-19患者的一个明显特征，SARS-CoV-2感染后患者炎症增加与免疫失衡有关。同时，研究发现与缺氧和炎症相关的过氧化物积累和高凝途径的增加导致COVID-19患者血管内皮细胞的进一步功能障碍，don't-eat-me signal的丧失也可能是COVID-19患者内皮功能障碍的重要机制，最终可能引发血管和组织的损伤并导致COVID-19患者全身性多器官损伤。

图3：激活的高凝通路与COVID-19严重程度的加速和恶化有关

随后，研究总结提出了一种基于COVID-19严重程度机制中的炎症和高凝途径的双重损伤机制，并基于此提出了机器学习模型（MLM）用于筛选COVID-19严重程度的潜在预测因子，获得了包含16个基因的特征集，作为COVID-19严重程度的潜在预测因子，并有可能用于分析COVID-19患者的病情。

图5：RTP患者与选择较短的BCR密切相关

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